大部分类型腺病毒感染可以自愈。
腺病毒的种类较多，不同种类腺病毒的致病性以及对身体的损害性存在一定的差异，大部分腺病毒感染主要侵袭呼吸道、尿道等黏膜组织，治疗效果一般较好。大多可在7~10天自愈，一般不留有严重后遗症。
部分腺病毒侵袭能力较强，如果在感染患者自身免疫能力较低情况下，存在一定概率引发脑炎、心肌炎的可能。如果是此类重症感染情况，一般建议患者到医疗机构规范接受抗病毒以及对症支持治疗。