怀孕早期查出甲亢，不需要进行特殊处理，只需要在妊娠中期进行进一步复查即可。
在怀孕早期，妊娠滋养细胞分泌的人绒毛膜促性腺激素与促甲状腺素的分子结构高度相似，会导致促甲状腺素的分泌减少而出现一过性的甲亢。这种情况一般在孕十二周后随着人绒毛膜促性腺激素水平下降后，促甲状腺素的水平也会逐渐恢复正常。所以可以通过孕中期的检查，进一步评估是否出现了甲亢的情况。
如果在妊娠中期仍有甲亢，或者在怀孕前就有甲亢，可以考虑通过药物治疗的方式进行处理。妊娠期的甲亢如果不进行有效控制，有可能引起甲亢危象的出现，而危及孕妇的安全。