输尿管肿瘤可以分为良性和恶性。良性输尿管肿瘤主要有息肉及囊肿，而恶性肿瘤主要有移行细胞癌、移行细胞合并鳞状上皮癌、粘液癌等类型。该疾病确诊后，则是需要及早行肾、输尿管及膀胱袖状切除术。若对侧肾功能不良，不能行上述手术或为单发乳头状肿瘤时，可行局部肿瘤切除并保留肾脏，术后定期复查。
其次对于良性肿瘤可行局部切除，输尿管重建吻合，必要时需要采取腹壁造瘘引出尿液。术后需要采取化疗等治疗，一般来说术后有膀胱存在的前提下，是需要定期采取膀胱内灌注化疗治疗。