颅内感染引起意识模糊可能是发烧引起的，也可能是脑组织损伤引起的。
头部在外伤打击，或者机体严重感染时候，病原体就可能通过外伤部位，或者血液传播进入颅内，由于颅内抵抗力偏弱，所以容易在颅内生长引起颅内感染。当病原体引起机体发烧，如果发烧温度高、持续时间长，就有可能引起脑部功能障碍出现意识模糊，另外，如果病原体生长破坏脑组织也可能引起意识模糊。
临床上主要是通过敏感的抗生素来抗感染治疗，通过杀灭病原体来促进疾病的早日恢复。