慢性肛裂一般是指二期肛裂和三期肛裂，大多是指病史超过两个月以上的肛裂。
慢性肛裂的裂口已经形成慢性溃疡，裂口周围的组织由于受溃疡裂口的反复炎症刺激，会导致纤维增生瘢痕形成，其中三期肛裂会合并有肛乳头肥大，以及哨兵痔，或者伴有皮下瘘管，肛隐窝炎症等。
而慢性肛裂治疗效果好的方法就是手术治疗，手术的目的是切除肛裂裂口以及其附属物，并且对肛管做降压处理，也就是切断部分肛门内括约肌，防止术后肛裂复发。