小肠间质瘤手术住院的时间，一般情况下2周左右就可以了。小肠间质瘤的手术属于中等类型的手术，手术难度不是太大。小肠间质瘤的手术难度，也取决于小肠间质瘤是早期、中期还是晚期。
如果是早期的小肠间质瘤，单纯将肿瘤切除就可以了。这样的手术相对比较简单、创伤比较小，住院的时间1~2周就可以了。
如果是中、晚期的小肠间质瘤，手术难度相对比较大。除了将肿瘤切除外，还需要做淋巴结的清扫。患者创伤比较大，住院的时间可能需要2~3周。