霉菌性阴道炎一般予以偏碱性的药物坐浴。因为霉菌性阴道炎的致病菌是假丝酵母菌，而假丝酵母菌在酸性的环境下更容易生长，使用偏碱性的药物可以改变阴道的酸碱度，从而对治疗霉菌有很好的效果。
霉菌性阴道炎除了予以洗液坐浴后，主要还需要予以抗真菌的药物来杀死霉菌，才可以达到彻底治愈。因此需要同时予以局部的用药治疗，或者是全身口服给药的方式。
霉菌性阴道炎在治疗的期间还要禁止性生活，并且在治疗后还要将内裤高温煮沸或者是更换内裤，要避免因为穿过去的内裤引起交叉感染的可能。