新生儿脑积水的形成，是由于新生儿在大脑发育的过程中，新生儿的脑脊液循环通路出现问题，导致脑脊液分泌过多，而脑脊液循环障碍，循环不通，吸收途径出现障碍，故脑脊液在脑室系统蛛网膜下腔积聚，引起脑室扩张、导致临床症状的综合征。
发病原因包括颅内出血、颅内炎症、外伤，以及先天性畸形，如Dandy-Walker综合征、导水管梗阻、Chiari畸形，造成梗阻性先天性脑积水。
针对于病因治疗是解除脑积水的根本方法，避免直接行脑室腹腔分流，以免造成后期严重的并发症。所以及时治疗新生儿脑积水，避免严重的后遗症，造成神经系统功能障碍是关键。