内分泌性的眼球突出一般是由于甲状腺功能亢进导致，所以在治疗上，首先需要积极治疗的是甲状腺疾病。
需要对症给予相应的药物治疗，以促进患者的甲状腺功能尽快地恢复正常。有部分患者甲状腺功能恢复正常之后，突眼的症状可以逐渐好转。
但是如果甲亢导致的突眼症状比较严重，导致患者的角膜暴露在外面，从而出现暴露性角膜炎的时候，就需要及时进行眶内减压术，促进眼球突出症状减轻。能够帮助眼睑闭合的时候能够较好地保护角膜，从而避免并发疾病。