腱鞘囊肿和腱鞘巨细胞瘤的区别主要有以下几方面：
腱鞘囊肿是位于肌腱外产生的囊性肿物，肿物一般不会随着肌腱的运动而产生运动，而且肿物一般是呈圆形、边界比较清晰、活动度良好、质地是属于软或者是中等硬度。而腱鞘巨细胞瘤一般是对肌腱进行侵袭性的生长，在肌腱活动的时候，随着肌腱会出现运动。
腱鞘巨细胞瘤一般是呈梭形，而且质地是呈中等硬度。另外，腱鞘巨细胞瘤和周围组织结构的边界并不是很清晰。在经过彩超检查的时候，腱鞘囊肿是呈液性密度影，而且肿物内不会出现血管影或者是血流的影像。而腱鞘巨细胞瘤经过彩超检查，是属于实性肿物，其内可以查到血管影。