隐性脊柱裂的后遗症，主要是产生脊柱的不稳以及造成迟发性的神经损害。
隐性脊柱裂大部分的患者，没有任何症状。一部分患者会出现局部的疼痛；一部分患者会表现为下肢的乏力、麻木；还有一部分患者会出现尿失禁的情况。
如果隐性脊柱裂遭受到损伤、劳损或者是退变等不良因素的刺激，会导致出现继发性的脊柱不稳，从而产生慢性的腰痛，产生运动功能障碍。
另外，如果隐性脊柱裂进展，导致其内走形的脊髓或者是神经跟受压、受刺激，将会产生这种迟发性的神经损害症状，包括产生肢体感觉异常、肌力减退、站立行走不稳以及二便功能障碍等症状。