治疗肠胃炎的原则主要是抗感染、禁止饮食、补充液体、纠正电解质紊乱，能缓解患者的症状。
肠胃炎主要分为急性、慢性肠胃炎，患者的临床表现不同，治疗方法也不同。急性肠胃炎考虑和饮食有关。比如生冷寒凉、被细菌病毒污染的食物摄入后，会导致胃肠道蠕动增强，引起腹痛腹泻等症状。通过口服或静脉输液抗感染的药物如吗丁啉，同时还要补充电解质治疗。
慢性肠炎常见的有溃疡性结肠炎、克隆氏病。通过注意饮食、避免寒凉、刺激性食物的摄入。口服双歧杆菌、乳酸菌，同时还要配合免疫抑制剂治疗。如果患者还有肠道炎症性表现，需要配合口服左氧氟沙星治疗。