肚脐眼里疼痛，可能是蛔虫病、急性胃肠炎、阑尾炎、肚脐受到炎症感染等原因引起的。
平时不注意个人的饮食卫生，容易造成肠道寄生虫感染，往往会表现为肚脐周围出现疼痛。发生急性胃肠炎时，也会造成肚脐周围疼痛，伴有腹泻等临床表现。
阑尾炎在起初发病时，可在肚脐周围疼痛逐渐转移到右下腹，有按压痛，伴有呕吐。肚脐眼局部受到感染，形成炎症性的反应，造成局部的皮肤升温、发红、疼痛，化验血常规，白细胞会增高。