大便有绿色脓性分泌物的处理，与患者的疾病临床表现以及疾病的严重程度有一定的关系。
假如患者大便有绿色的脓性分泌物，考虑是直肠或者结肠炎症感染导致，可以通过保守治疗的方式缓解，包括给患者合理使用抗感染药物，尤其是明确受到细菌感染的患者，合理选择敏感的抗炎药物，成为该疾病治疗的关键。
也可以做细菌的培养以及药物的敏感试验，根据检查结果，假如通过口服用药治疗的方式，症状不能明显缓解，必要时可以通过注射用药的方式改善患者的症状。