真菌性和霉菌性龟头炎实际上是一种疾病，没有区别。
霉菌性龟头炎是由于真菌感染龟头而引起的一种炎症性疾病，在临床上也叫做念珠菌性龟头炎。霉菌性龟头炎的发病主要和卫生习惯以及长时间服用抗生素导致身体免疫力下降，真菌感染龟头而引起龟头炎，霉菌性龟头炎的治疗主要选择抗真菌类抗生素对症治疗，症状比较轻，外用药物治疗为主。
如果身体其它部位有真菌性疾病，可以配合抗真菌药物口服治疗。真菌性龟头炎具有交叉感染性，在治疗期间要注意性生活卫生，最好暂停性生活，这样对龟头炎的恢复比较好。