引起肛窦炎及肛乳头炎发生，通常是由于长期的排便习惯不良或者消化道疾病，比如便秘、腹泻等所导致局部发生了炎症、水肿所引起。因此，在饮食上一定需要注意多吃蔬菜、水果、富含膳食纤维的食物，这样有利于保持大便的通畅，同时需要忌烟酒、忌辛辣饮食，否则会导致症状加重，每天也要保持良好的排便习惯，保持每日定时排便，避免便秘或者腹泻，同时需要积极治疗相关疾病，比如腹泻或者便秘，可以使用一些药物进行调理。
对于肛窦炎及肛乳头炎早期除了饮食调理之外，还可以采用一些外用药物或者熏洗法治疗，比如使用中药熏洗或者甲硝唑氯化钠注射液保留灌肠或者肛入痔疮栓等。