肛周脓肿术后，不仅是能用清水清洗肛门周围的，而且最好是要频繁清洗。因为肛周脓肿术中，只是将脓腔打开，将脓液及大部分的坏死组织清除，脓腔内还是会遗留脓液，及少量坏死组织的，所以术后肛门周围经常会有脓液，及坏死物质存积。如果不及时将其清洗干净，还有可能导致继发感染。
清洗时要注意使用温热的清水，不能使用凉水，每天清洗次数不限，只要发现肛周有脓液或坏死组织就可以清洗。尤其在排便后，应该将粪便清洗干净。
有的患者，觉得清水不具有消毒杀菌的效果，不应该使用，这时可以使用中草药泡水熏洗。如蒲公英、金银花、紫花地丁等，这些药物具有清热解毒杀菌的功效，能很好的促进脓腔内的脓液，及坏死组织排出体外及切口愈合，不足的一点就是价格比较贵。