男性生殖系统结核的发病原因和治病途径主要有两种，一都是通过血液从身体的其他结核病灶转移而来，另一种是肾结核患者带结核菌的尿从尿道流过时从射精管经输精管感染造成。
因为男性生殖系统和泌尿系统有一个共同的通道，因此男性泌尿系结核与生殖系结核有密切的关系。男性生殖系结核，可以直接破坏睾丸，使其不能产生精子而影响生育。结核形成的病灶，还可阻塞输精管道，使精子排出减少，甚至造成梗阻性无精子症，都会影响受孕。另外因泌尿生殖系结核常是全身结核的一个部分，患病的机体整个功能都会下降，也是影响生育的一个因素。