孕激素与卵巢早衰有一定关系，孕激素不会导致卵巢早衰。
但是卵巢早衰之后，孕激素水平会大幅度的下降。在卵巢早衰以后，绝经前后过渡期的时候，卵巢还是有一些排卵功能的，仍然会有少量的孕激素，但是因为这个时期的卵泡生长发育的质量和状态都不好，导致黄体功能也是分泌不足，所以自然而然的分泌的孕酮也会减少。随着卵巢功能下降，慢慢绝经就没有了孕激素的分泌。
也就是说卵巢早衰的人群，以及围绝经期前后的人群，有很多的女性会出现异常子宫出血，就是因为孕激素水平低下导致的，临床上叫做异常子宫出血，也叫无排卵性出血。