肛裂的临床检查手段在急性期时，不建议进行肠镜或肛门镜检查。主要因素是患者因为肛门剧烈疼痛，拒绝配合，经常导致检查失败。同时，不用器械依据临床表现及体征也可明确诊断，检查意义不大。
如果患者的临床表现，不能用肛裂所解释，必要时就要进行肠镜检查。比如，便血较多、颜色黑暗、带有粘液等；同时，肛门区的疼痛呈持续性加重，而肛裂的局部情况反而减轻，均需要进行肠镜检查。
在检查前，一定要患者清洁肠道；同时，做好医患沟通，必要时可给予止疼药物或者安定类药物。