睾丸囊肿多数情况下是会影响性功能的。
因为睾丸存在囊肿后，会影响睾丸生成睾丸酮的能力，使睾丸酮分泌不足。而睾丸酮是性激素的一种，是维持人正常性功能的重要物质。所以患有睾丸囊肿，会导致人出现性欲低下、性生活会劳累感增强、阴茎勃起硬度不佳等现象。另外，患有睾丸囊肿还会压迫阴茎海绵体，导致阴茎海绵体供血不足。这时也会影响人正常性功能，导致阴茎勃起硬度下降，或者导致人性生活时间缩短。
睾丸囊肿是常见疾病，患病后会引起睾丸肿胀、疼痛，需要服用活血化瘀、消肿类药物治疗。严重时可以考虑手术切除囊肿。