乳管内乳头状瘤患者是需要手术治疗的。要结合患者病变情况不同选择相应的手术方案。由于患者经常出现乳管狭窄、堵塞的情况，容易诱发局部乳房脓肿。因此，对于出现感染的患者，要积极进行抗生素抗炎治疗，同时进行脓肿切除引流术，清理脓液促进恢复。
在病情稳定以后，对于良性病变患者要结合病变累及范围，采取单纯病灶切除、乳房区段切除或者单纯乳房切除手术等。在患者术前一定要进行病理检查，由于部分患者可能发生癌变改变，所以术前病理为恶性，术中就要采取肿瘤根治术，清扫附近淋巴结组织，降低病变复发与转移几率。