儿童时期的单纯肥胖症，不可以应用药物进行治疗。
因为对于儿童肥胖症的治疗有一个基本的原则，禁止采用禁食的方法和饥饿的方法来进行减肥减重，禁止短时期快速的减肥减重，也禁止使用减肥药物或减肥食品，禁止使用手术治疗，还有所谓的物理治疗、震荡疗法，来治疗儿童时期的肥胖症。因此，儿童时期的肥胖症是不可以用药物来进行治疗的。
但是如果儿童肥胖症合并糖尿病、高脂血症、一些高尿酸血症，这个时候可以在医生的指导下应用药物治疗。儿童时期肥胖症的减肥主要应用运动的方法，也要根据儿童生长发育的需要，按照营养师计算的热量，给予孩子个体化的食物的配置来进行减重。