轮状病毒性腹泻症状可表现为大便次数多、量多、水分多、黄色水样便或蛋花样便带少量粘液、无腥臭味等。
严重的轮状病毒性腹泻，大便可以呈水样，一点粪渣都看不到。常并发发热、脱水、酸中毒以及电解质紊乱。如眼窝、囟门凹陷，尿少、泪少、皮肤、粘膜干燥、弹性下降、精神不振，口唇殷红、呼吸深大，呼出气体闻着有烂苹果味、腹痛、腹胀、心律失常等症状，还可产生惊厥等神经系统症状。
轮状病毒性肠炎为自限性疾病，数日后呕吐症状渐停，腹泻减轻。不喂食乳类的宝宝恢复更快，自然病程约三到八天，少数病程较长。