心房肥大发生的原因和以下方面的因素有关系：
左心房肥大。目前引起左心房肥大的疾病，常见的有二尖瓣狭窄。当二尖瓣狭窄严重的情况下，最先引起的心脏肥大就是左心房肥大发生，并且常常合并心房颤动、心律失常发生。此外，长期高血压状态也会引起左心房肥大现象发生。
右心房肥大。目前常见的原因主要是肺源性心脏病。此外，肺动脉高压以及肺动脉瓣狭窄等疾病，都会引起右心房肥大现象发生。其他的器质性心脏病随着心力衰竭加重，出现右心衰的现象，也会引起右心房肥大现象发生。