附睾炎主要是通过药物治疗，是能够治好。在附睾炎的治疗上，一般考虑为普通的细菌感染，只需要用对抗生素和足够的疗程，附睾炎一般可以治愈。
对于继发于其他疾病之上的附睾炎，除了治疗本身疾病外，还要对引起附睾炎的诱发因素予以治疗。最常见的是前列腺增生，它可以导致附睾炎反复发作，如果对前列腺增生予以治疗，可能附睾炎发作的频率会降低。
对于久治不愈的附睾炎，或者附睾炎反复发作，患者的临床表现严重，可以考虑行附睾切除术，也要考虑是否有附睾结合的可能，排除肺部有无肺结核的可能。