三叉神经痛可能会引起眼睛疼痛。三叉神经痛主要是指三叉神经分布区域存在疼痛，而人体的眼睛部位存在三叉神经的分支，所以眼睛部位也是三叉神经所支配的区域，而三叉神经痛往往是由于半月神经节或神经根遭受压迫，对脑干感觉核或三叉神经的感觉神经根造成侵犯所引起，当侵犯到分布在眼部的三叉神经时，就可引起眼睛疼痛。如果侵犯的是三叉神经的下颌分支，则不会引起眼睛疼痛。
虽然三叉神经痛可导致患者出现眼睛疼痛，但出现眼睛疼痛，也不能盲目判定就一定是三叉神经痛所引起，青光眼也会引起眼睛疼痛，需要进行鉴别。