脑膜炎的患者大多数经过积极正确的治疗，是可以临床治愈的。一少部分患者可能会留有后遗症，主要见于重症脑膜炎。患者可能会出现意识障碍，包括昏迷状态、植物状态，可能会出现认知功能障碍，也可以出现记忆功能下降等。
脑膜炎临床上常见的病原菌包括细菌、真菌和病毒。由结核杆菌引起的脑膜炎一般称为结核性脑膜炎；真菌引起的脑膜炎称为真菌性脑膜炎；由脑膜炎双球菌引起的脑膜炎，临床上一般称为化脓性脑膜炎；由病毒引起的脑膜炎，临床上一般称为病毒性脑膜炎。
发病后要及时地进行治疗，包括抗病原体治疗以及脑保护对症支持等。