器质性不射精症是一种有其他病因继发的病症，常见病因有以下几种：
1.先天性输精管畸形及尿道憩室，前者由于精液外出的通路不畅而无法射出，后者为射精时精液进入憩室而不排除体外。
2.大脑侧叶病变，该部发生病变后，即使性欲正常，性交时也不能射精，若行大脑侧叶切除，可出现永久性的射精障碍。
3.脊髓神经的损伤，如胸12至腰1骶髓段神经损伤后常出现不射精症。
4.传导神经障碍，如施行腰部交感神经切除术、腹膜后淋巴结清扫术都能损伤传导神经，造成射精障碍。
5.局部病变，膀胱颈松弛、精阜肥大、阴茎外伤、硬结、瘢痕、纤维化、较重的尿道下裂均有射精障碍的可能。
6.其他，如垂体功能低下、甲状腺功能亢进、肢端肥大症、粘液性水肿等，常为射精障碍的发病原因。