定坤丹水蜜丸在其说明书中，标明的不良反应为尚不明确，但并不足以说明其完全没有不良反应。
因每个患者的个体差异和病情不同，在临床应用中也发现有个别患者，在用药期间常出现上火症状，口气偏重，还有部分患者可出现腹泻，而对于有些敏感体质者，在用药后还有出皮疹现象。
因此，患者在服用定坤丹水蜜丸后，若出现以上不良症状时，需要及时停药，最好要去医院就诊检查。本药物虽然服用后一般不会出现不良反应，但是建议患者尽量要咨询医师后再用药为宜。