房间隔缺损是先天性的。
房间隔缺损是心脏发育时期出现的疾病，此病主要在孕妇怀孕期间开始出现。孕妇怀孕之后如果受到了病毒的感染，可以影响到房间隔部分的发育，使房间隔出现发育不全，就可以表现为房间隔缺损。
影响房间隔发育的因素有很多，在怀孕早期受到射线的照射，也可能出现房间隔缺损。孕妇在怀孕早期出现营养不良，也可能会影响心脏的正常发育。怀孕8周之内是心脏形成的重要时期，在此阶段如果受到了干扰心脏发育的因素，就会形成房间隔缺损。