睡一晚上起来腰疼可以由以下几种原因引起：
1.骶髂关节的疾病。比如骶髂关节的关节炎，或者强直性脊柱炎、类风湿而导致的骶髂关节疾病、脊柱疾病，就可以出现睡觉之后起来腰疼的症状，要通过X线片检查以及化验血等给予诊断和治疗。
2.腰肌劳损或者筋膜炎。这时可以出现局部腰疼，可以伴有活动受限，在着凉劳累时疼痛非常明显。所以在睡一晚觉之后出现腰疼的症状要及早休息，同时给予微波理疗、远红外线理疗等给予治疗。
3.睡觉时受风着凉而导致的腰痛，这时可以出现经络的不畅而导致腰疼，可以给予膏药的贴敷等一些方法给予治疗。