肾盂肾炎是指的患者上尿路发生感染，主要是由于患者发生感染，才会得肾盂肾炎。
一般95%的患者都是因为上行感染所致，也就是大肠杆菌可以从尿道感染到膀胱，然后再到输尿管，最后到达肾盂，导致患者发生肾盂肾炎。上行感染的大部分原因都是因为患者尿道不通畅，或者患者留置导尿管的时间过长。
少数患者因为致病菌通过血液到达肾脏，该类致病菌为金黄色葡萄球菌，通过血行感染。极少数患者可以通过直接感染，由于肾脏周围的组织发生感染，进而直接播散到肾脏而引起肾盂肾炎，对于肾盂肾炎是需要抗感染治疗的。