轻度的输尿管口脱垂，无明显的不适，不需要治疗，注意随访观察就可以。
当输尿管口脱垂造成排尿困难、尿路感染、输尿管结石、肾脏积水、肾功能丧失等危害时，就需要进行手术治疗。输尿管口脱垂易造成输尿管口狭窄， 尿液可以慢慢渗出， 但非常容易阻塞， 容易引起同侧输尿管、肾脏积水，影响肾脏功能，所以要定期复查肾功和泌尿系彩超。
当输尿管口脱垂伴有输尿管口位置异常时，容易引起排尿次数增多、尿急、小便疼痛，严重时可有反复的发热及脓性尿液，注意及时应用抗感染药物治疗。