甲胎蛋白高并不会引起癌症，而是在发生癌症之后患者会出现甲胎蛋白高的情况。
大部分甲胎蛋白高都是原发性肝癌和生殖细胞恶性肿瘤造成的。其中最为多见就是原发性肝癌，在这一类癌症患者当中，有超过半数人都会甲胎蛋白超标严重的情况，但只能作为辅助诊断措施，还需要进行CT、病理性分析等来确诊。
另外，肝炎、肝硬化等病人也会出现甲胎蛋白升高的情况，但其指标都会小于200μg/L，必须找到相关病因之后进行针对性治疗，及时将癌症控制。