心脏神经症的治疗以心理治疗为主，药物治疗为辅，首先应耐心倾听病史，了解可能的发病原因和有关因素，进行仔细的体格检查，和必要的实验室检查，解除病人疑虑，然后通俗易懂的讲解疾病性质，可以用一些暗示性语言，帮助病人解除顾虑，鼓励病人调整心态，安排好作息时间，适量进行文娱，旅游和体育活动。
无论心脏神经症还是器质性心血管病，合并精神心理问题的，提倡双心医学的治疗模式，在积极合理治疗合并的心血管器质性疾病同时，焦虑症状明显的病人，可选用抗焦虑药物，带有忧郁的病人，可选用三环类抗抑郁药。
目前认为，选择性五羟色胺再摄取抑制剂，对心血管副作用较小，安全性高于三环类抗抑郁药，但该类药物起效较慢，一般两周开始有效，可以考虑作为伴有抑郁病人的首选，同时应该多考虑进行精神心理行为治疗，如心理疏导，行为矫正，生物反馈治疗等。