附睾囊肿患者手术治疗后可能会影响生育，主要是因为手术后，可能会造成附睾管出现阻塞，影响精子正常输出，致使男性不能排除精子而导致不育。所以附睾囊肿患者能否手术治疗，要谨慎考虑。
如果附睾囊肿较小，没有明显症状表现，通常不用治疗，只需要定期复查，密切了解囊肿大小。
如果附睾囊肿较大，对睾丸或附睾造成了压迫，引发患者阴囊胀痛，通常需要手术治疗，将囊肿切除。但如果是未婚或有生育要求的男性不建议手术治疗。