肛瘘外口闭合了，先不要急于进行手术。因为这时外口不容易准确定位，容易造成一些不必要的损伤。
可以先服用一些抗菌药物，如头孢呋辛等，以控制感染症状。还可使用一些消肿止痛的中药，泡水坐浴，通过热疗减轻术区的炎症，从而减少肛瘘反复发作的次数。
不能长时间坐位，要尽量采用卧位。还要注意避免便秘及腹泻，因为便秘及腹泻均能加重肛瘘内口处的感染症状，从而使肛瘘病情反复发作。
如果感染严重，外口处因闭合不能通畅引流，局部会形成新的脓肿。