生理性飞蚊症和病理性飞蚊症的临床症状类似，都是表现为眼前黑影漂浮不定。但生理性飞蚊症的症状相对更轻一些，病理性飞蚊症的眼前黑影更多、更大，有的呈片状、絮状。
二者都不会影响患者的视力，并且目前尚无明确有效的治疗方法，药物治疗效果差。
就发病原因而言，生理性飞蚊症的发生是由于患者玻璃体液化变性引起的，病理性飞蚊症可由眼部疾病导致，比如葡萄膜炎、玻璃体炎等引起，若玻璃体混浊牵拉引起视网膜脱离，可以导致患者视力下降，应当及时处理。