便秘肛门疼可以通过以下一些治疗方法缓解：
首先，患者需要治疗便秘，因为便秘患者大多伴有大便干燥，排便时就容易损伤肛管皮肤，而引起肛门疼痛症状。患者可以通过口服乳果糖或者聚乙二醇4000散剂使大便软化，并配合口服肠道益生菌类药物调节肠道菌群，从而消除便秘症状。
其次，肛门局部可以使用药物控制疼痛，比如可以使用复方角菜酸酯栓塞肛门或者外用麝香痔疮膏。
再次，症状严重的患者在排便时，可以临时使用开塞露润滑肛管减轻疼痛。