先天性心脏病微创手术的费用与不同医疗机构、不同疾病有关，也与患者的年龄、康复能力和康复程度有关。
微创手术和常规手术的价格差别不大，大概在几百块钱左右。病人的手术费用取决于手术后的恢复情况，包括微创手术在内的心脏手术费用在三千元左右，其余都在药物上。
如果病人恢复得很快，气管插管就提前拔除，病人吃得很好，没有肺部并发症，不需要营养支持，而且费用是免费的。如果病人很虚弱，咳痰和咳嗽、肺炎，需要很多消炎药、抗生素。如果病人跟不上营养，需要营养支持，那么钱就比较多了。