超声波治疗目前主要用于口腔科、呼吸科超声的雾化治疗，以及肿瘤科用超声波治疗一些恶性肿瘤等。
超声波治疗具有简单方便，对身体的损伤小、价格低廉等优点。但是它对人体也有一定的影响，一般小剂量的对身体影响不大。但是大剂量的超声波会对人体各系统有一定的影响，比如对神经系统的影响，大剂量的超声波可以导致末梢神经血管麻痹、组织缺氧甚至是坏死。
对冠状动脉也有一定的影响，可引起血管收缩，甚至是血管的运动神经麻痹，造成血液流动停止。
人的眼睛对超声波是比较敏感的，大剂量的超声可以导致交感神经性的眼炎、结膜充血，以及眼底改变等。
再就是超声波对生殖系统也有一定的影响，大剂量的超声波可以使卵泡变性甚至导致胚胎的畸形或者是流产。