女性患有原发性痛经时，需要和一些继发性痛经相鉴别。比如说女性的子宫内膜息肉、巧克力囊肿。当女性患有子宫内膜息肉的时候，可以出现月经周期的异常，宫腔内环境发生了改变，可以引起不孕症。在做超声检查的时候会发现子宫内膜不均厚，有的在宫腔内可以看到低回声区，宫腔镜的检查是有助于鉴别的。患有卵巢巧克力囊肿的女性，常常是痛经，月经量增多，因为它改变了女性盆腔的内环境，同样可以导致不孕症的出现。做妇科检查的时候，在附件区可以摸到囊性的包块，活动度比较差。超声检查提示附件区有囊性的肿物，囊肿当中回声不是清亮的，可以有很多光点回声，抽血化验妇科肿瘤标记物会发现CA125水平升高。