结核性子宫内膜炎的治疗主要就是抗结核治疗，这一定要规范合理、全程治疗、足量的药物治疗，需要就诊结核科，而不是妇科做抗结核治疗。
抗结核治疗一定是一个长时间的疗程的规范治疗才可以。结核性子宫内膜炎即使是在规范治疗之后，也常常会遗留严重的后遗问题，也就是子宫内膜严重受损的问题，常常就同时会存在子宫内膜受损而导致的月经量过度减少或者闭经等等的现象。
必要时要做宫腔镜的检查和治疗，主要也要靠雌激素和各种中药的治疗来帮助子宫内膜生长、帮助提高怀孕的几率。