小便时尿道疼可能为尿道损伤、尿道感染或者是尿道结石等因素所引起。
如果尿道部位遭受了损伤，比如性生活过度或者是外力撞击，会导致尿道内存在破损的伤口。在小便时，伤口部位会受到尿液的刺激，就可出现尿道疼痛，一般还伴有轻度的出血。
如果存在尿道炎，由于炎症会对尿道黏膜造成刺激，就会引起排尿疼痛，还伴有尿频、尿急等症状。
如果尿道内也存在结石或者异物，在排尿时，结石或者异物会对尿道造成损伤，就可导致排尿疼痛，可通过泌尿系统CT或B超等检查明确诊断。