小儿胆道蛔虫症可以通过服用高效、低毒的广谱驱虫药进行杀虫治疗。
小儿胆道蛔虫症通常会导致患儿出现剧烈的疼痛症状，一般疼痛的部位是在上腹部剑突右下方，对于这种剧烈疼痛的症状可以通过使用解痉止痛类药物来缓解症状。对于合并胆道感染的情况时临床上可以通过使用青霉素类抗生素等来治疗。
临床上有一部分小儿胆道蛔虫症需要及时进行手术治疗，需要切开胆总管将蛔虫取出。如果患儿出现了急性严重的胆道感染或者是胆道内出血或坏死时需要通过手术来治疗。