脑炎引起的发热，如果体温超过38.5℃时，可以应用一些退热的药物。常用的药物有赖氨匹林、柴胡注射液、氨基比林注射液，也可以口服对乙酰氨基酚等。
同时要积极的抗病毒治疗。临床上常用的药物有阿昔洛韦和更昔洛韦。一部分脑炎是由于细菌感染引起，必要时也可以应用一些抗菌的药物。临床上常用的有头孢类抗生素，头孢曲松钠和头孢哌酮、舒巴坦。
患者如果发生脑炎引起发热，严重时，可能会导致患者全身乏力，也可能会引起一些神经系统的其他表现，应及时的综合治疗。