头上出现疙瘩疼，最常见的情况是患了毛囊炎或者疖肿。毛囊炎和疖肿都属于一类感染性的皮肤疾病，通常是细菌感染导致，主要是一些金黄色葡萄球菌，也可能是表皮葡萄球菌感染导致。
还有一种可能是真菌感染导致的毛囊炎，如马拉色菌毛囊炎导致，也会出现头上有疙瘩、疼痛明显的情况发生。
出现头上疙瘩疼痛，通常由于局部温度比较高，或者出汗比较多、卫生习惯不好。还有一些慢性疾病，比如糖尿病或者使用了一些糖皮质激素的人，都是很容易在头顶部出现长毛囊炎或者疖肿的情况，就会出现有疙瘩疼痛的情况。