引起龟头火辣痛的原因可见于过敏、病菌感染、摩擦损伤等。
过敏体质进食芒果、接触花粉等，导致组胺释放可引发火辣、疼痛、发痒等不适感觉。包皮过长导致龟头部位清洗困难，容易积聚包皮垢引发感染。未做好性保护，被性伴侣生殖道真菌、支原体等感染，可引起龟头火辣感、发痒等不适感觉。
发生于手淫性行为后的火辣疼痛，提示龟头部位受到损伤。该性行为对阴茎皮肤，以及龟头等部位摩擦刺激性较大，可引起损伤性火辣痛，外观还可见发红、水肿表现。