B超检查是能够检查出胎儿唇腭裂的。
在妊娠中期进行检查是比较准确的，这时候胎儿发育适中并且羊水适量。B超下胎儿位置好，可以清楚地观察胎儿的体表是否有畸形，例如唇腭裂、脊柱裂、六指等情况发生。B超检查也并不是万能的，如果存在胎位不正常，或者胎儿姿势异常的情况，可能不能够检查出来，因此需要动态观察胎儿的发育。
另外女性在怀孕早期的时候，需要做NT检查、唐氏筛查等，也有利于发现胎儿其他的畸形情况。